YOK начал процесс реструктуризации академических, институциональных и административных аспектов в высшем образовании.

По основе правительскому закону все высшие учебные заведения в Турции объединились под крышей YÖK; академии, университеты, учебные заведения были преобразованы в факультеты образования, а консерватории и профессиональные высшие школы (VHS) были присоединены к университетам.

YÖK стал отвечать за все высшие учебные заведения как учреждение, обладающее автономией и общественной идентичностью в рамках полномочий и обязанностей, предоставленных ему статьями 130 и 131 Конституции и указанными положениями Закона.

По этой причине YÖK сосредоточился на том, чтобы в основном отвечать за стратегическое планирование высшего образования, координацию между университетами и, что наиболее важно, на создании и поддержании механизмов обеспечения качества.