Alfraganus universitetida quyidagi magistratura mutaxassisliklari mavjud bo’lib, bitiruvchi bosqich talabalarining magistrlik dissertatsiya himoyalari bo’lib o’tmoqda.

— Iqtisodiyot (tarmoqlar va sohalar bo‘yicha)

— Turizm (faoliyat turlari boʻyicha)

— Falsafa (sohalar boʻyicha)

— Pedagogika va psixologiya

— Lingvistika (ingliz tili)

— Lingvistika (rus tili)

— O‘zbek tili va adabiyoti

— Kompyuter injiniringi

— Sport faoliyati (faoliyat turlari bo‘yicha)

Magistrlik dissertatsiya himoyalarida respublikamizda taniqli va yuqori salohiyatga ega bo’lgan qator akademiklar, professorlar va soha mutaxassis-rahbarlari Davlat Attestatsiyasi Komissiya raisi va a’zolari sifatida ishtirok etmoqdalar.

Alfraganus universiteti 2023-2024 o’quv yili magistratura bosqichi bitiruvchi talabalari universitetning ilk bitiruvchilari hisoblanadi.